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（1899-1947）台北水返腳人（今汐止），淡水中學校長。
1927年日本京都帝國大學物理系畢業，返台後在淡水中學任教、結婚、擔任淡水教會執事。他是基督徒世家的第三代，感於福音使命與神學知識的重要，1937年至東京神學校進修。
沉穩的條理分析風格，展現在作品之中。他擅長運用科學解釋自然界的現象，並闡述聖經裡的話語，彰顯造物主的大能；也藉由探索科學，進而辯證自己對信仰的堅定。
1940年攻讀神學畢業，持續從事教育工作，任教台南長榮中學（前身長老教會中學）、兼任台南東門教會傳道師。1942年任台北神學校（今台灣神學院）代理校長。1944年擔任台北宮前女學校教務長，是提高女信徒就學率和栽培女宣道人才的機構。
1945年11月，擔任淡水中學（今淡江高中）教務主任，與校長林茂生搭配。1946年5月，陳能通接下校長職務，此時接管台灣的國府獨裁、社會混亂，學校面臨經費不足、師資缺乏的困境，但他仍在刻苦之中多方奔走尋找資源以穩住校務，確保長老教會學校的自主權。
8月「台省第一屆青年夏令營」在淡水中學舉辦，夏令營兼主任為陳儀、副主任為柯遠芬。陳能通想把日治時期學校留存的軍訓槍枝交給柯遠芬處理，但他以日後還有軍事訓練課程為由寫字條要學校保管槍枝；另柯遠芬亦要求在校內蓋中國式八角涼亭，被陳能通以此構想與歐式設計的校園景觀不合且經費拮据為由婉拒。
228事件波及淡水時，他在3月初做出停課決定，要學生暫避紛亂。然而3月10日未及返家的學生郭曉鐘，在淡水街上被軍隊無故射殺身亡。他與校內的體育老師兼訓導主任黃阿統，將學生遺體運回學校。
3月11日清晨，軍人抵達校長宿舍強拉走陳能通，連同父親陳旺、黃阿統皆被帶走。遭綑綁於淡水沙崙海水浴場的樹上整晚。陳能通與黃阿統之後下落不明。國府事後羅織兩人罪狀為煽動學生暴亂。
以傳道、教育為終生志業的陳能通，總在艱困時期扛起重擔，教育家的特質，即使面對強權也使命必達、以理服人。典型的學者、認真的思想家，他是上帝的牧羊人。
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