228事件波及花蓮，3月4日，他率領青年到三青團花蓮分團部，要求召集民眾大會，會中組織228事件處理委員會花蓮分會，喊出「打倒貪官污吏，台灣自治萬歲！」的口號，走和平改革路線。他擔任由青年聯合組成的「青年大同盟」總指揮，維持治安、民生問題，收繳武器以避免衝突與暴亂，是重要參與者。
228事件發生時，擔任228事件處理委員會治安委員，在動亂中善盡職責，公正處事，穩定民心，並前往軍法處調查過失殺人的私煙查緝員偵辦狀況，另外也主張陸海空幹部應由台籍人士擔任。他於3月9日之後的大屠殺中，蒙難。後被政府指控叛國、煽動暴動、內亂罪等罪名。
228事發，3月初蔓延到屏東，動盪不安，他商請名醫大舅子郭一清，不分省籍照顧因衝突而受傷的人，事後多人登門道謝。3月4日，屏東市長龔履端擅離職守躲在屏東機場，議長張吉甫以生病為由亦不出面，葉秋木被推舉為臨時市長，擔任228事件處理委員會屏東分會主任委員，肩負起治安維護的責任，此為「屏東三四事件」。
他經手不少國府貪腐、枉法的案件，與吳鴻麒推事常檢討司法界的惡習與黑暗，除了感慨還勸告外省籍同仁要秉持法紀公正辦案。 228事件發生後，林桂端在3月7日至10日間，被憲兵以「王添灯有事找你」為由帶走，失蹤。推測他提供王添灯在228事件處理委員會提案的〈32條處理大綱〉法律諮詢，被視為擋路石。
他經常出入王添灯的「文山茶行」討論時政，於1946年3月高票當選台北市參議員。7月發生「迎（むかえ）婦產科」官司事件，日籍醫師被控醫療過失、侵害病患致死，遭索賠巨款。他秉持醫學專業及民意代表職責，力挺科學證據，聯合保釋醫師，得罪軍方背景的家屬。
2月27日傍晚的緝煙事件後，接下全台恐怖的整肅，才是更可怕的，尤其是3月8日來自中國的軍隊，兵分二路，從台灣的基隆港和高雄港上岸，沿路密集射擊，台灣陷入血腥的鎮壓。
228曾是危險、悲情的符號。隨著時間演進，轉變為守護台灣的重要印記。
